شهدت الفترة الأخيرة طفرة كبيرة في نمو البرمجيات العلمية، مما خلق عوائق عملية أمام أبحاث المعلوماتية الحيوية. فبينما تتوفر الآن بوفرة طرق إحصائية تعتمد على الذكاء الاصطناعي (Artificial Intelligence - AI)، إلا أن الاستخدام الفعّال لها غالباً ما يواجه صعوبات بسبب التوزيع المجزأ، وعدم اتساق الوثائق، وتعقيد التبعيات، وصعوبة إعادة إنتاج بيئات التنفيذ.

لذا، نقدم لكم منصة PoSyMed، وهي منصة مفتوحة ومرنة تهدف إلى التكامل المنظم وتنسيق وتنفيذ أدوات المعلوماتية الحيوية وسير العمل. تجمع PoSyMed بين معمارية مركزية خلفية، ووصف أدوات رسمي، وعمليات بناء وتنفيذ تعتمد على الحاويات (Container-based)، بالإضافة إلى حالة سير عمل دائمة، وواجهة مستخدم تعتمد على الحوار.

تعمل نماذج اللغات الضخمة (Large Language Models - LLM) في PoSyMed وليس كصناع قرار مستقلين، بل كواجهة تفاعلية بين الإنسان والآلة، حيث تساعد في تحديد الأدوات، واقتراح خطوات سير العمل، ودعم البرمجة ضمن بيئة تنفيذ مُعتمَدة ومُشرفة بشريًا.

تهدف PoSyMed إلى تحسين مستوى إمكانية إعادة الإنتاج، والتتبع، والشفافية في التحليل البيولوجي العملي ضمن منصة واحدة. وفي هذا المقال، نستعرض هيكل النظام ونُقيم أداءه في مجموعة من السيناريوهات البيولوجية التمثيلية، فيما يتعلق بدعم سير العمل، وتصميم التفاعل، وقابلية توسعة المنصة.

يمكنكم تجربة منصة PoSyMed عبر الرابط: https://apps.cosy.bio/posymed.